« Clade » : différence entre les versions

Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre.
Contenu supprimé Contenu ajouté
Monophylétique au lieu de holophylétique dans la définition
Balises : Modification par mobile Modification par le web mobile
Un "e" de trop (c'est le "choix" qui est indépendant)
 
(35 versions intermédiaires par 21 utilisateurs non affichées)
Ligne 2 : Ligne 2 :
{{ébauche|origine et évolution du vivant}}
{{ébauche|origine et évolution du vivant}}


[[Fichier:Clade-grade_II.svg|right|thumb|334 px|Cladogramme fictif, avec en vert au centre un [[grade évolutif]] [[paraphylétique]], réuni sur des considérations génétiques, anatomiques et/ou physiologiques, en plus des considérations phylogénétiques. En rouge et bleu des clades basés uniquement sur des critères phylogénétiques (mais qui pourraient par hasard être également des grades).]]
[[Fichier:Clade-grade_II.svg|right|thumb|334 px|Cladogramme fictif avec, en rouge et en bleu, des clades (ou groupes monophylétiques) basés uniquement sur des critères phylogénétiques. En vert, au centre, un [[grade évolutif|grade]] [[paraphylétique]] (ou groupe paraphylétique), réuni sur d'autres considérations.]]


Un '''clade''' (du [[grec ancien]] : {{grec ancien|κλάδος|kládos}}, « branche »), aussi appelé [[Monophylie|groupe monophylétique]], est un groupe d'organismes, vivants ou ayant vécu, comprenant un organisme particulier et la totalité de ses descendants<ref name=Hennig>{{Ouvrage|langue=de|prénom1=Willi|nom1=Hennig|lien auteur=Willi Hennig|titre=Grundzüge einer Theorie der phylogenetischen Systematik|traduction titre=Fondements d'une théorie de la systématique phylogénétique|lieu=Berlin|éditeur=Deutscher Zentralverlag|année=1950|pages totales={{VIII}}-370|oclc=12126814}}.</ref>{{,}}<ref name="Darlu et tassy">{{Ouvrage|prénom1=Pierre|nom1=Darlu|prénom2=Pascal|nom2=Tassy|titre=La reconstruction phylogénétique. Concepts et Méthodes|année=1993|lieu=Paris|éditeur=Masson|collection=Collection biologie théorique|numéro dans la collection=7|pages totales={{XV}}-245|format={{Unité|24|cm}}|isbn=2225842299|ean=9782225842290|oclc=29187265}}.</ref>.
Un '''clade''' (du [[grec ancien|grec]] ''κλάδος'' / ''clados''<!-- code langue grc-Ltn ? ou autre ? éventuellement indiquer le terme dans l’alphabet grec ? -->, qui signifie « branche ») est un groupe [[monophylétique]] d'organismes, vivants ou ayant vécu, comprenant un organisme particulier et la totalité de ses descendants.


== Définition ==
== Définition ==
Le clade est l’unité de base de la [[classification phylogénétique]] ou [[cladisme]], qui est proposé par certains comme une alternative à la [[systématique évolutionniste]] qui reconnait parfois des [[taxon]]s qui ne sont pas des clades. Le statut des [[clades]] varie en fonction de la version du cladisme qui adoptée par l'auteur d'une classification : certains proposent de traiter les [[clades]] comme des taxons de la [[Classification linnéenne|tradition linnéenne]] en leur assignant des [[rang taxonomique|rangs taxonomiques]] (classes, ordres, familles, etc.), tandis que d'autres rejettent cette idée et souhaitent plutôt une liste indentée de noms de clades mais dépourvus de rangs<ref>{{en}} Kluge N.J. 1999. A system of alternative nomenclatures of supra-species taxa. Linnaean and post-Linnaean principles of systematics. // ''[[Revue russe d'entomologie|Entomological Review]]'' 79(2): 133-147 [http://www.insecta.bio.spbu.ru/z/pdf/Kluge1999-erev0133_abstract.pdf résumé]. {{ru}} [http://www.insecta.bio.spbu.ru/z/pdf/Kluge1999-224-243.pdf texte intégral]</ref>.
Le clade est l’unité de base de la [[classification phylogénétique]] (voir aussi [[cladistique]]). Le statut des clades varie en fonction de la version du cladisme adoptée par l'auteur d'une classification : certains proposent de traiter les clades comme des [[Taxon|taxons]] de la [[Classification linnéenne|tradition linnéenne]] en leur assignant des [[rang taxonomique|rangs taxonomiques]] (classes, ordres, familles, etc.)<ref name=apg4>{{Article|langue=en|prénom1=M. W.|nom1= Chase|prénom2=M. J. M.|nom2=Christenhusz|et al.=oui|titre=An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV|périodique=Botanical Journal of the Linnean Society|volume=181|numéro=1|jour=06|mois=04|année=2016|passage=1-20|doi=10.1111/boj.12385|lire en ligne=https://academic.oup.com/botlinnean/article-pdf/181/1/1/17041938/boj12385.pdf|format=pdf|consulté le=2020-05-26}}.</ref>, tandis que d'autres rejettent cette idée et souhaitent plutôt une liste indentée de noms de clades dépourvus de rangs<ref>{{Article|langue=ru|prénom1=N. J.|nom1=Kluge|titre=Система альтернативных номенклатур надвидовых таксонов|traduction titre=Un système de nomenclatures alternatives des taxons supraspécifiques|périodique=[[Revue russe d'entomologie]]|volume={{LXXVIII}}|numéro=1|année=1999|issn=0367-1445|éditeur=[[Académie des sciences de Russie]]|passage=224-243}}.</ref>{{,}}<ref>{{Ouvrage|langue=en|prénom1=Peter|nom1=Ax|titre=Multicellular Animals|volume=I|titre volume=A New Approach to the Phylogenetic Order in Nature|lieu=Berlin, Heidelberg|éditeur=Springer|année=1996|mois=06|jour=28|pages totales=225|isbn=978-3540608035|oclc=851393142}}.</ref>. Un clade regroupe ainsi un ancêtre et l’ensemble de ses descendants, il représente donc une totalité de descendance. La classification phylogénétique du vivant actuelle reconnait majoritairement des clades<ref name=apg4/>{{,}}<ref name=Lecointre>{{Ouvrage|prénom1=Guillaume|nom1=Lecointre|lien auteur=Guillaume Lecointre|prénom2=Hervé|nom2=Le Guyader|titre=[[Classification phylogénétique du vivant]]|éditeur=Belin|tome=I|mois=10|année=2016|numéro édition=4|année première édition=2001|pages totales=608|isbn=978-2-7011-8294-0}}.</ref>{{,}}<ref>{{Article|langue=en|prénom1=Kevin|nom1=de Queiroz|titre=The PhyloCode and the Distinction between Taxonomy and Nomenclature|périodique=Systematic Biology|volume=55|numéro=1|date=2006-02-01|issn=1076-836X|issn2=1063-5157|doi=10.1080/10635150500431221|lire en ligne=https://academic.oup.com/sysbio/article/55/1/160/2842921|consulté le=2018-05-05|pages=160–162}}.</ref>.


== Origine ==
Un clade regroupe ainsi un ancêtre et l’ensemble de ses descendants, il représente donc une totalité de descendance. La classification phylogénétique du vivant ne reconnait actuellement que les clades, mais il existe des systèmes alternatifs comme la [[systématique évolutionniste]] qui reconnait également les [[grades évolutifs]]. Ceux-ci regroupent des organismes partageant un même niveau de complexité morphologique et physiologique, ils peuvent être aussi bien [[holophylétique]]s que [[paraphylétique]]s<ref name=aub17>{{ouvrage|langue=fr|prénom1=Damien|nom1=Aubert|titre=Classer le vivant|sous-titre=Les perspectives de la systématique évolutionniste moderne|éditeur=Ellipses|date=2017|ISBN=9782340017733}}</ref>.
En [[biologie]], [[Edwin Ray Lankester|Lankester]] introduit le terme « clade » en 1911<ref name="Lankester1911">{{Article |langue=en |nom1=Lankester |prénom1=Edwin Ray |lien auteur1=Edwin Ray Lankester |titre=Zoology |périodique=Encyclopædia Britannica |lien périodique=Encyclopædia Britannica |volume=28 |titre volume=Vetch – Zymotic Diseases |année=1911 |pages=1022-1039 }}. {{Wikisource|en|titre=Zoology |lien=1911 Encyclopædia Britannica/Zoology|éditeur=Encyclopædia Britannica |date=1911}}.</ref> pour signifier en [[anglais]] la catégorie taxonomique ''{{lang|la|cladus}}'' utilisée en 1868 par [[Ernst Haeckel|Haeckel]]<ref name="Cavalier-Smith1998">{{Article |langue=en |nom1=Cavalier-Smith |prénom1=Thomas |lien auteur1=Thomas Cavalier-Smith |titre=A revised six-kingdom system of life |périodique=Biological Reviews |éditeur=Cambridge Philosophical Society |lien éditeur=Cambridge Philosophical Society |volume=73 |numéro=3 |mois=August |année=1998 |pages=203–266 |issn=1464-7931 |doi=10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x}}.</ref>.


En 1957, dans le domaine de la [[systématique évolutionniste]], [[Julian Huxley|Huxley]] dénomme ''clades'' les « unités monophylétiques » résultant de la [[cladogenèse]]<ref name="Huxley1957">{{Article |langue=en |nom1=Huxley |prénom1=Julian |lien auteur1=Julian Huxley |titre=The Three Types of Evolutionary Process |périodique=Nature |lien périodique=Nature (revue) |volume=180 |numéro=4584 |année=1957 |pages=454–455 |issn=0028-0836 |doi=10.1038/180454a0}}.</ref>. Il entend alors « monophylétique » avec sa signification [[Systématique évolutionniste|évolutionniste]], c'est-à-dire ne contenant pas nécessairement tous les descendants du dernier ancêtre commun du groupe. Les clades ''sensu'' Huxley ne seraient donc plus tous aujourd'hui reconnus comme des clades, le sens hennigien (de [[Willi Hennig]], 1950) de « clade » ayant été adopté par toutes les écoles de [[systématique]].
Le choix de la philosophie classificatoire (les différentes versions des systématiques [[Cladisme|cladiste]] ou [[Systématique évolutionniste|évolutionniste]]) est dans tous les cas indépendante du type de caractères ([[Morphologie|morpho]]-[[Anatomie|anatomo]]-[[physiologique]], ou bien [[Phylogénétique moléculaire|moléculaire]]) analysé par le scientifique<ref name=aub17 />.


== Utilisation du clade comme unité de classification et controverse ==
== Origine ==
En [[biologie]], [[Edwin Ray Lankester|Lankester]] introduit le terme « clade » en 1911<ref name="Lankester1911">{{Article |langue=en |nom1=Lankester |prénom1=Edwin Ray |lien auteur1=Edwin Ray Lankester |titre=Zoology |périodique=Encyclopædia Britannica |lien périodique=Encyclopædia Britannica |volume=28 |titre volume=Vetch – Zymotic Diseases |année=1911 |pages=1022-1039 }}. {{Wikisource|en|titre=Zoology |lien=1911 Encyclopædia Britannica/Zoology|éditeur=Encyclopædia Britannica |date=1911}}</ref> pour signifier en [[anglais]] la catégorie taxonomique ''{{lang|la|cladus}}'' utilisée en 1868 par [[Ernst Haeckel|Haeckel]]<ref name="Cavalier-Smith1998">{{Article |langue=en |nom1=Cavalier-Smith |prénom1=Thomas |lien auteur1=Thomas Cavalier-Smith |titre=A revised six-kingdom system of life |périodique=Biological Reviews |éditeur=Cambridge Philosophical Society |lien éditeur=Cambridge Philosophical Society |volume=73 |numéro=3 |mois=August |année=1998 |pages=203–266 |issn=1464-7931 |doi=10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x}}.</ref>.


La [[classification phylogénétique]] se fondant sur l'utilisation des clades diffère de la [[systématique évolutionniste]] qui elle se fonde sur des critères additionnels pour établir une classification (critères [[Morphologie (biologie)|morphologiques]], [[écologie|écologiques]], [[physiologie|physiologiques]], [[génétique|génétiques]] etc.), consistant en groupes appelés [[grade évolutif|grades]]. Par ailleurs, un clade peut être un grade mais tous les grades ne sont pas des clades<ref name=aub17>{{Ouvrage|prénom1=Damien|nom1=Aubert|titre=Classer le vivant|sous-titre=Les perspectives de la systématique évolutionniste moderne|éditeur=Ellipses|lieu=Paris|année=2017|pages totales=496|isbn=978-2-340-01773-3}}.</ref>. En [[systématique évolutionniste]], clade est synonyme de groupe [[holophylétique]] (en systématique évolutionniste un groupe [[monophylétique]] peut aussi être [[paraphylétique]])<ref>{{Article|prénom1=Alain|nom1=Dubois|lien auteur=Alain Dubois|titre=À propos de l’emploi controversé du terme « monophylétique » : nouvelles propositions|périodique=Bulletin mensuel de la [[Société linnéenne de Lyon]]|année=1986|volume=LV|numéro=7|passage=248-254|doi=10.3406/linly.1986.10766|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/linly_0366-1326_1986_num_55_7_10766|consulté le=2020-05-26}}.</ref>.
En 1957, dans le domaine de la [[systématique évolutionniste]], [[Julian Huxley|Huxley]] dénomme ''clades'' les « unités monophylétiques » résultant de la [[cladogenèse]]<ref name="Huxley1957">{{Article |langue=en |nom1=Huxley |prénom1=Julian |lien auteur1=Julian Huxley |titre=The Three Types of Evolutionary Process |périodique=Nature |lien périodique=Nature (revue) |volume=180 |numéro=4584 |année=1957 |pages=454–455 |issn=0028-0836 |doi=10.1038/180454a0}}.</ref>. Il entend alors « monophylétique » avec sa signification [[Systématique évolutionniste|évolutionniste]], c'est-à-dire ne contenant pas nécessairement tous les descendants du dernier ancêtre commun du groupe. Les clades ''sensu'' Huxley ne seraient donc plus tous aujourd'hui reconnus comme des clades, le sens hennigien de « clade » ayant été adopté par toutes les écoles de systématique.

Le choix de la philosophie classificatoire (les différentes versions des systématiques [[Cladisme|cladiste]] ou [[Systématique évolutionniste|évolutionniste]]) est dans tous les cas indépendant du type de caractères ([[morphologie (biologie)|morpho]]-[[Anatomie|anatomo]]-[[physiologique]], ou bien [[Phylogénétique moléculaire|moléculaire]]) analysé par le scientifique<ref name="aub17"/>.


== Notes et références ==
== Notes et références ==
Ligne 22 : Ligne 24 :


== Voir aussi ==
== Voir aussi ==
{{Autres projets
| commons = <!-- Commons -->
| wikispecies = <!-- Wikispecies -->
| wiktionary = clade
| wikiversity = <!-- Wikiversity -->
}}

=== Articles connexes ===
=== Articles connexes ===
* [[Arbre phylogénétique]]
* [[Arbre phylogénétique]]
* [[Clade basal]]
* [[Groupe-couronne]]
* [[Groupe-couronne]]
* [[Groupe frère]]
* [[Photo-guide taxinomique du monde animal]]
* [[Photo-guide taxinomique du monde animal]]
* [[Photo-guide taxinomique du monde végétal]]
* [[Monophylie]]
* [[Monophylie]]
* [[Paraphylie]]
* [[Paraphylie]]
* [[Polyphylie]]
* [[Polyphylie]]


{{Palette|Taxinomie}}
{{Palette|Taxinomie|Vocabulaire paléontologique/biologie}}
{{Portail|biologie|évolution|Histoire de la zoologie et de la botanique}}
{{Portail|biologie|évolution|Histoire de la zoologie et de la botanique}}



Dernière version du 12 décembre 2022 à 13:36

Cladogramme fictif avec, en rouge et en bleu, des clades (ou groupes monophylétiques) basés uniquement sur des critères phylogénétiques. En vert, au centre, un grade paraphylétique (ou groupe paraphylétique), réuni sur d'autres considérations.

Un clade (du grec ancien : κλάδος / kládos, « branche »), aussi appelé groupe monophylétique, est un groupe d'organismes, vivants ou ayant vécu, comprenant un organisme particulier et la totalité de ses descendants[1],[2].

Définition[modifier | modifier le code]

Le clade est l’unité de base de la classification phylogénétique (voir aussi cladistique). Le statut des clades varie en fonction de la version du cladisme adoptée par l'auteur d'une classification : certains proposent de traiter les clades comme des taxons de la tradition linnéenne en leur assignant des rangs taxonomiques (classes, ordres, familles, etc.)[3], tandis que d'autres rejettent cette idée et souhaitent plutôt une liste indentée de noms de clades dépourvus de rangs[4],[5]. Un clade regroupe ainsi un ancêtre et l’ensemble de ses descendants, il représente donc une totalité de descendance. La classification phylogénétique du vivant actuelle reconnait majoritairement des clades[3],[6],[7].

Origine[modifier | modifier le code]

En biologie, Lankester introduit le terme « clade » en 1911[8] pour signifier en anglais la catégorie taxonomique cladus utilisée en 1868 par Haeckel[9].

En 1957, dans le domaine de la systématique évolutionniste, Huxley dénomme clades les « unités monophylétiques » résultant de la cladogenèse[10]. Il entend alors « monophylétique » avec sa signification évolutionniste, c'est-à-dire ne contenant pas nécessairement tous les descendants du dernier ancêtre commun du groupe. Les clades sensu Huxley ne seraient donc plus tous aujourd'hui reconnus comme des clades, le sens hennigien (de Willi Hennig, 1950) de « clade » ayant été adopté par toutes les écoles de systématique.

Utilisation du clade comme unité de classification et controverse[modifier | modifier le code]

La classification phylogénétique se fondant sur l'utilisation des clades diffère de la systématique évolutionniste qui elle se fonde sur des critères additionnels pour établir une classification (critères morphologiques, écologiques, physiologiques, génétiques etc.), consistant en groupes appelés grades. Par ailleurs, un clade peut être un grade mais tous les grades ne sont pas des clades[11]. En systématique évolutionniste, clade est synonyme de groupe holophylétique (en systématique évolutionniste un groupe monophylétique peut aussi être paraphylétique)[12].

Le choix de la philosophie classificatoire (les différentes versions des systématiques cladiste ou évolutionniste) est dans tous les cas indépendant du type de caractères (morpho-anatomo-physiologique, ou bien moléculaire) analysé par le scientifique[11].

Notes et références[modifier | modifier le code]

  1. (de) Willi Hennig, Grundzüge einer Theorie der phylogenetischen Systematik [« Fondements d'une théorie de la systématique phylogénétique »], Berlin, Deutscher Zentralverlag, , VIII-370 p. (OCLC 12126814).
  2. Pierre Darlu et Pascal Tassy, La reconstruction phylogénétique. Concepts et Méthodes, Paris, Masson, coll. « Collection biologie théorique » (no 7), , XV-245 p., 24 cm (ISBN 2225842299, EAN 9782225842290, OCLC 29187265).
  3. a et b (en) M. W. Chase, M. J. M. Christenhusz et al., « An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV », Botanical Journal of the Linnean Society, vol. 181, no 1,‎ , p. 1-20 (DOI 10.1111/boj.12385, lire en ligne [PDF], consulté le ).
  4. (ru) N. J. Kluge, « Система альтернативных номенклатур надвидовых таксонов » [« Un système de nomenclatures alternatives des taxons supraspécifiques »], Revue russe d'entomologie, Académie des sciences de Russie, vol. LXXVIII, no 1,‎ , p. 224-243 (ISSN 0367-1445).
  5. (en) Peter Ax, Multicellular Animals, vol. I : A New Approach to the Phylogenetic Order in Nature, Berlin, Heidelberg, Springer, , 225 p. (ISBN 978-3540608035, OCLC 851393142).
  6. Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader, Classification phylogénétique du vivant, t. I, Belin, , 4e éd. (1re éd. 2001), 608 p. (ISBN 978-2-7011-8294-0).
  7. (en) Kevin de Queiroz, « The PhyloCode and the Distinction between Taxonomy and Nomenclature », Systematic Biology, vol. 55, no 1,‎ , p. 160–162 (ISSN 1076-836X et 1063-5157, DOI 10.1080/10635150500431221, lire en ligne, consulté le ).
  8. (en) Edwin Ray Lankester, « Zoology », Encyclopædia Britannica, vol. 28 « Vetch – Zymotic Diseases »,‎ , p. 1022-1039. (en) Zoology, Encyclopædia Britannica,  (Wikisource anglophone).
  9. (en) Thomas Cavalier-Smith, « A revised six-kingdom system of life », Biological Reviews, Cambridge Philosophical Society, vol. 73, no 3,‎ , p. 203–266 (ISSN 1464-7931, DOI 10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x).
  10. (en) Julian Huxley, « The Three Types of Evolutionary Process », Nature, vol. 180, no 4584,‎ , p. 454–455 (ISSN 0028-0836, DOI 10.1038/180454a0).
  11. a et b Damien Aubert, Classer le vivant : Les perspectives de la systématique évolutionniste moderne, Paris, Ellipses, , 496 p. (ISBN 978-2-340-01773-3).
  12. Alain Dubois, « À propos de l’emploi controversé du terme « monophylétique » : nouvelles propositions », Bulletin mensuel de la Société linnéenne de Lyon, vol. LV, no 7,‎ , p. 248-254 (DOI 10.3406/linly.1986.10766, lire en ligne, consulté le ).

Voir aussi[modifier | modifier le code]

Sur les autres projets Wikimedia :

Articles connexes[modifier | modifier le code]