« Clade » : différence entre les versions
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[[Fichier:Clade-grade_II.svg|right|thumb|334 px|Cladogramme fictif, avec en rouge et bleu des clades (ou groupes monophylétiques) basés uniquement sur des critères phylogénétiques. En vert au centre un [[grade évolutif|grade]] [[paraphylétique]] (ou groupe paraphylétique), réuni sur d'autres considérations.]] |
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Un '''clade''' (du [[grec ancien|grec]] ''κλάδος'' / ''clados''<!-- code langue grc-Ltn ? ou autre ? éventuellement indiquer le terme dans l’alphabet grec ? -->, qui signifie « branche ») |
Un '''clade''' (du [[grec ancien|grec]] ''κλάδος'' / ''clados''<!-- code langue grc-Ltn ? ou autre ? éventuellement indiquer le terme dans l’alphabet grec ? -->, qui signifie « branche »), aussi appelé [[Monophylie|groupe monophylétique]] est un groupe d'organismes, vivants ou ayant vécu, comprenant un organisme particulier et la totalité de ses descendants <ref name=Hennig>{{Ouvrage|langue=anglais|auteur1=Willi Hennig|traducteur=D. Dwight Davis et Rainer Zangerl|titre=Phylogenetic Systematics|passage=|lieu=Urbana, Chicago, London|éditeur=University of Illinois Press|date=1966|pages totales=263|isbn=|lire en ligne=https://books.google.fr/books?hl=fr&lr=&id=xsi6QcQPJGkC&oi=fnd&pg=PA1&dq=hennig+1966+phylogenetic+systematics&ots=QvDyovOA5V&sig=afXfmjR83c7TIs1owZe0h9BrdM4#v=onepage&q=hennig%201966%20phylogenetic%20systematics&f=false}}</ref>{{,}}<ref name = Darlu et tassy> P. Darlu & P. Tassy, 1993. La reconstruction phylogénétique. Concepts et Méthodes, ''Masson''</ref>. |
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Le clade est l’unité de base de la [[classification phylogénétique]] (voir aussi [[cladistique]]). Le statut des [[clades]] varie en fonction de la version du cladisme adoptée par l'auteur d'une classification : certains proposent de traiter les [[clades]] comme des taxons de la [[Classification linnéenne|tradition linnéenne]] en leur assignant des [[rang taxonomique|rangs taxonomiques]] (classes, ordres, familles, etc.) <ref name=apg4>{{En}}The Angiosperm Phylogeny Group, 2016. An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV. ''Botanical Journal of the Linnean Society, Volume 181, Issue 1, 1 May 2016, Pages 1–20'' [[https://doi.org/10.1111/boj.12385]]</ref>, tandis que d'autres rejettent cette idée et souhaitent plutôt une liste indentée de noms de clades mais dépourvus de rangs<ref>{{en}} Kluge N.J. 1999. A system of alternative nomenclatures of supra-species taxa. Linnaean and post-Linnaean principles of systematics. // ''[[Revue russe d'entomologie|Entomological Review]]'' 79(2): 133-147 [http://www.insecta.bio.spbu.ru/z/pdf/Kluge1999-erev0133_abstract.pdf résumé]. {{ru}} [http://www.insecta.bio.spbu.ru/z/pdf/Kluge1999-224-243.pdf texte intégral]</ref>{{,}}<ref>Ax, P. 1996. Multicellular Animals: A new Approach to the Phylogenetic Order in Nature. ''Srpinger''</ref>. Un clade regroupe ainsi un ancêtre et l’ensemble de ses descendants, il représente donc une totalité de descendance. La classification phylogénétique du vivant actuelle reconnait majoritairement des clades <ref name=apg4/>{{,}}<ref name=Lecointre> Lecointre G. et Le Guyader H. 2016. Classification phylogénétique du vivant. ''Belin'' [http://ISBN%20978-2-7011-8294-0 ISBN 978-2-7011-8294-0]</ref>{{,}}<ref>{{Article|langue=en|prénom1=Kevin|nom1=de Queiroz|titre=The PhyloCode and the Distinction between Taxonomy and Nomenclature|périodique=Systematic Biology|volume=55|numéro=1|date=2006-02-01|issn=1076-836X|issn2=1063-5157|doi=10.1080/10635150500431221|lire en ligne=https://academic.oup.com/sysbio/article/55/1/160/2842921|consulté le=2018-05-05|pages=160–162}}</ref>. |
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Un clade regroupe ainsi un ancêtre et l’ensemble de ses descendants, il représente donc une totalité de descendance. La classification phylogénétique du vivant ne reconnait actuellement que les clades, mais il existe des systèmes alternatifs comme la [[systématique évolutionniste]] qui reconnait également les [[grades évolutifs]]. Ceux-ci regroupent des organismes partageant un même niveau de complexité morphologique et physiologique, ils peuvent être aussi bien [[holophylétique]]s que [[paraphylétique]]s<ref name=aub17>{{ouvrage|langue=fr|prénom1=Damien|nom1=Aubert|titre=Classer le vivant|sous-titre=Les perspectives de la systématique évolutionniste moderne|éditeur=Ellipses|date=2017|ISBN=9782340017733}}</ref>. |
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| ⚫ | Le choix de la philosophie classificatoire (les différentes versions des systématiques [[Cladisme|cladiste]] ou [[Systématique évolutionniste|évolutionniste]]) est dans tous les cas indépendante du type de caractères ([[Morphologie|morpho]]-[[Anatomie|anatomo]]-[[physiologique]], ou bien [[Phylogénétique moléculaire|moléculaire]]) analysé par le scientifique<ref name=aub17 |
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== Origine == |
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En 1957, dans le domaine de la [[systématique évolutionniste]], [[Julian Huxley|Huxley]] dénomme ''clades'' les « unités monophylétiques » résultant de la [[cladogenèse]]<ref name="Huxley1957">{{Article |langue=en |nom1=Huxley |prénom1=Julian |lien auteur1=Julian Huxley |titre=The Three Types of Evolutionary Process |périodique=Nature |lien périodique=Nature (revue) |volume=180 |numéro=4584 |année=1957 |pages=454–455 |issn=0028-0836 |doi=10.1038/180454a0}}.</ref>. Il entend alors « monophylétique » avec sa signification [[Systématique évolutionniste|évolutionniste]], c'est-à-dire ne contenant pas nécessairement tous les descendants du dernier ancêtre commun du groupe. Les clades ''sensu'' Huxley ne seraient donc plus tous aujourd'hui reconnus comme des clades, le sens hennigien de « clade » ayant été adopté par toutes les écoles de systématique. |
En 1957, dans le domaine de la [[systématique évolutionniste]], [[Julian Huxley|Huxley]] dénomme ''clades'' les « unités monophylétiques » résultant de la [[cladogenèse]]<ref name="Huxley1957">{{Article |langue=en |nom1=Huxley |prénom1=Julian |lien auteur1=Julian Huxley |titre=The Three Types of Evolutionary Process |périodique=Nature |lien périodique=Nature (revue) |volume=180 |numéro=4584 |année=1957 |pages=454–455 |issn=0028-0836 |doi=10.1038/180454a0}}.</ref>. Il entend alors « monophylétique » avec sa signification [[Systématique évolutionniste|évolutionniste]], c'est-à-dire ne contenant pas nécessairement tous les descendants du dernier ancêtre commun du groupe. Les clades ''sensu'' Huxley ne seraient donc plus tous aujourd'hui reconnus comme des clades, le sens hennigien de « clade » ayant été adopté par toutes les écoles de systématique. |
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== Utilisation du clade comme unité de classification et controverse == |
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== Notes et références == |
== Notes et références == |
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Version du 7 mai 2018 à 22:28
Pour les articles homonymes, voir Clade (homonymie).
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Un clade (du grec κλάδος / clados, qui signifie « branche »), aussi appelé groupe monophylétique est un groupe d'organismes, vivants ou ayant vécu, comprenant un organisme particulier et la totalité de ses descendants [1],Erreur de référence : Paramètre invalide dans la balise <ref>.
Définition
Le clade est l’unité de base de la classification phylogénétique (voir aussi cladistique). Le statut des clades varie en fonction de la version du cladisme adoptée par l'auteur d'une classification : certains proposent de traiter les clades comme des taxons de la tradition linnéenne en leur assignant des rangs taxonomiques (classes, ordres, familles, etc.) [2], tandis que d'autres rejettent cette idée et souhaitent plutôt une liste indentée de noms de clades mais dépourvus de rangs[3],[4]. Un clade regroupe ainsi un ancêtre et l’ensemble de ses descendants, il représente donc une totalité de descendance. La classification phylogénétique du vivant actuelle reconnait majoritairement des clades [2],[5],[6].
Origine
En biologie, Lankester introduit le terme « clade » en 1911[7] pour signifier en anglais la catégorie taxonomique cladus utilisée en 1868 par Haeckel[8].
En 1957, dans le domaine de la systématique évolutionniste, Huxley dénomme clades les « unités monophylétiques » résultant de la cladogenèse[9]. Il entend alors « monophylétique » avec sa signification évolutionniste, c'est-à-dire ne contenant pas nécessairement tous les descendants du dernier ancêtre commun du groupe. Les clades sensu Huxley ne seraient donc plus tous aujourd'hui reconnus comme des clades, le sens hennigien de « clade » ayant été adopté par toutes les écoles de systématique.
Utilisation du clade comme unité de classification et controverse
La classification phylogénétique se basant sur l'utilisation des clades diffère de la systématique évolutionniste qui elle se base sur des critères additionnels pour établir une classification (critères écologiques, physiologiques, génétiques etc.), consistant en groupes appelés grades. Par ailleurs, un clade peut être un grade mais tous les grades ne sont pas des clade [10]. En systématique évolutionniste, clade est synonyme de Groupe holophylétique (en systématique évolutionniste un groupe monophylétique peut aussi être paraphylétique) [11].
Le choix de la philosophie classificatoire (les différentes versions des systématiques cladiste ou évolutionniste) est dans tous les cas indépendante du type de caractères (morpho-anatomo-physiologique, ou bien moléculaire) analysé par le scientifique [10].
Notes et références
- (en) Willi Hennig (trad. D. Dwight Davis et Rainer Zangerl), Phylogenetic Systematics, Urbana, Chicago, London, University of Illinois Press, , 263 p. (lire en ligne)
- (en)The Angiosperm Phylogeny Group, 2016. An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV. Botanical Journal of the Linnean Society, Volume 181, Issue 1, 1 May 2016, Pages 1–20 [[1]]
- (en) Kluge N.J. 1999. A system of alternative nomenclatures of supra-species taxa. Linnaean and post-Linnaean principles of systematics. // Entomological Review 79(2): 133-147 résumé. (ru) texte intégral
- Ax, P. 1996. Multicellular Animals: A new Approach to the Phylogenetic Order in Nature. Srpinger
- Lecointre G. et Le Guyader H. 2016. Classification phylogénétique du vivant. Belin ISBN 978-2-7011-8294-0
- (en) Kevin de Queiroz, « The PhyloCode and the Distinction between Taxonomy and Nomenclature », Systematic Biology, vol. 55, no 1, , p. 160–162 (ISSN 1076-836X et 1063-5157, DOI 10.1080/10635150500431221, lire en ligne, consulté le )
- (en) Edwin Ray Lankester, « Zoology », Encyclopædia Britannica, vol. 28 « Vetch – Zymotic Diseases », , p. 1022-1039. (en) Zoology, Encyclopædia Britannica, (Wikisource anglophone)
- (en) Thomas Cavalier-Smith, « A revised six-kingdom system of life », Biological Reviews, Cambridge Philosophical Society, vol. 73, no 3, , p. 203–266 (ISSN 1464-7931, DOI 10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x).
- (en) Julian Huxley, « The Three Types of Evolutionary Process », Nature, vol. 180, no 4584, , p. 454–455 (ISSN 0028-0836, DOI 10.1038/180454a0).
- Damien Aubert, Classer le vivant : Les perspectives de la systématique évolutionniste moderne, Ellipses, (ISBN 9782340017733)
- Dubois, A. (1986). À propos de l’emploi controversé du terme “monophylétique”: nouvelles propositions. Bulletin mensuel de la Société linnéenne de Lyon, 55, 248-254.
