Chordata (classification phylogénétique)

Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Chordata (ou Chordés), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre les différents groupes (ou taxa) d'organismes vivants. Du fait de ses méthodes nouvelles basées notamment sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essor et propose parfois des résultats en contradiction avec l'ancienne classification uniquement basée sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi certains points particuliers font-ils encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.

Ce cladogramme mentionne aussi bien les groupes encore représentés dans la nature actuelle que ceux qui sont éteints (il inclut donc les groupes fossiles).

Le cladogramme présenté ici ne possède qu'une valeur indicative. Il n'est pas forcément consensuel, et on peut toujours se référer à la bibliographie au bas de l'article.

Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré. Tout nœud de l'arbre portant plus de deux branches montre une indétermination de la phylogénie interne du groupe considéré.

Les habitudes typographiques des botanistes et des zoologistes sont différentes. Ici, par commodité de lecture, et certains groupes actuels relevant des deux domaines traditionnels, les noms de taxons supérieurs au genre sont tous écrits en caractères droits, les noms de genres ou d'espèces en italiques.

À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien ; (Edi) : Édiacarien. Pour plus de précision si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.

Arbre phylogénétique

▲
└─o Chordata
  ├─o Cephalochordata
  │ ├─? Metaspriggina (éteint)
  │ ├─o Cathaymyrus (éteint)
  │ ├─o Pikaia (éteint)
  │ └─o Acrania
  │   ├─? Paleobranchiostoma (éteint)
  │   └─o Amphioxiformes
  │     ├─o Branchiostomidae
  │     └─o Epigonichthyidae ou Asymmetrontidae
  └─o Olfactores
    │
    ├─o Urochordata ou Tunicata ►
    └─o
      ├─o Haikouella (éteint)
      └─o Craniata
        ├─o Hyperotreti
        │ ├─o Gilpichthys (éteint)
        │ └─o
        │   ├─o Myxinikela (éteint)
        │   └─o Myxiniformes ou Myxinidae
        │     ├─o Eptatretinae
        │     ├─o Paramyxininae
        │     ├─o Myxininae
        │     └─o Quadratinae
        └─o Vertebrata
          ├─? Myllokunmingia (éteint)
          │
          ├─o Hyperoartia ►
          └─o
            ├─o Conodonta (éteint) ►
            └─o
              ├─o Pteraspidomorphi (éteint) ►
              └─o
                ├─? Anaspida
                │ ├─? Endeiolepidae (éteint)
                │ ├─o Jaymoytiiformes (éteint)
                │ │ ├─o Achanarellidae (éteint)
                │ │ ├─o Jaymoytiidae (éteint)
                │ │ └─o Euphaneropsidae (éteint)
                │ └─o
                │   ├─o Pharyngolepis (éteint)
                │   └─o
                │     ├─o Pterygolepis (éteint)
                │     └─o
                │       ├─o Rhyncholepididae (éteint)
                │       └─o Birkeniida (éteint)
                │         ├─o Lasaniidae (éteint)
                │         ├─o Ramsaasalepididae (éteint)
                │         └─o Birkeniidae (éteint)
                └─o Thelodontomorphi
                  ├─o 
                  │ ├─o
                  │ │ ├─o Nikoliviidae (éteint)
                  │ │ └─o Furcacaudiformes (éteint)
                  │ │   ├─o Pezopallichthyidae (éteint)
                  │ │   └─o Furcacaudiidae (éteint)
                  │ └─o Thelodontida (éteint)
                  │   ├─o Thelodontidae (éteint)
                  │   └─o
                  │     ├─o
                  │     │ ├─o Archipelepididae (éteint)
                  │     │ └─o Turiniidae (éteint)
                  │     └─o
                  │       ├─o Apalolepididae (éteint)
                  │       └─o Lanarkiidae (éteint)
                  └─o
                    ├─o Katoporida (éteint)
                    │ ├─o Loganelliidae (éteint)
                    │ ├─o Phlebolepididae (éteint)
                    │ ├─o Katoporodontidae (éteint)
                    │ └─o Shieliidae (éteint)
                    └─o
                      ├─o Galeaspida (éteint)
                      │ ├─o Hanyangaspidae (éteint)
                      │ └─o
                      │   ├─o Xiushuiaspis (éteint)
                      │   ├─o Dayongaspidae (éteint)
                      │   ├─? Duyunolepidae (éteint)
                      │   ├─? Lungmenshanaspidae (éteint)
                      │   ├─? Tridensaspidae (éteint)
                      │   ├─? Nanpanaspidae (éteint)
                      │   └─o
                      │     ├─o Eugaleaspidiformes (éteint)
                      │     │ ├─o Galeaspidae (éteint)
                      │     │ └─o Eugaleaspidae (éteint)
                      │     └─o Polybranchiaspidida (éteint)
                      │       ├─o Polybranchiaspidiformes (éteint)
                      │       └─o Huananaspidiformes (éteint)
                      └─o
                        ├─o
                        │ ├─o Gnathostomata ►
                        │ │
                        │ └─o Loganiidae (éteint)
                        ├─o Pituriaspida (éteint)
                        └─o Osteostraci (éteint)
                          ├─o Ateleaspis (éteint)
                          ├─o Aceraspis (éteint)
                          ├─o Tuvaspis (éteint)
                          └─o
                            ├─o Hirella (éteint)
                            └─o
                              ├─o Hemicyclaspis (éteint)
                              ├─? Tannuaspidida (éteint)
                              └─o Cornuta (éteint)
                                ├─o Cephalaspidida (éteint)
                                └─o
                                  ├─o Zenaspidida (éteint)
                                  └─o
                                    ├─o Benneviaspidida (éteint)
                                    │ ├─o Benneviaspididae (éteint)
                                    │ └─o Boreaspididae (éteint)
                                    └─o
                                      ├─o Kiaeraspidida (éteint)
                                      └─o Thyestiida (éteint)
                                        ├─o Tremataspidae (éteint)
                                        ├─o Dartmuthiidae (éteint)
                                        ├─o Sclerodontidae (éteint)
                                        └─o Thyestiidae (éteint)

Débat scientifique relatif à la phylogénie des Chordata

La place respective des Urocordés et des Céphalocordés n'est pas l'objet d'un consensus. Par contre, l'exclusion des Myxines du sein des Vertébrés, ainsi que le caractère largement polyphylétique des Agnathes, sont aujourd'hui largement admis. La relation basée sur des caractères morphologiques entre Anaspidés et Lamproies semble devoir être remise en cause, ainsi que la monophylie des Thélodontes, grade ancestral des Céphalaspidomorphes eux-mêmes paraphylétiques (loin des Lamproies, et au sein desquels s'originent les Gnathostomes).