Utilisateur:Antoine2003/Hafnia (bacterium)

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Hafnia est un genre de bactéries Gram-négatives, facultativement anaérobies, bactéries en forme de tige tige de la famille des Enterobacteriaceae. La bactérie Hafnia alvei est commensale du tube digestif humain, et habituellement non pathogène, mais peut causer des maladies chez les immunodéprimés, les patients. Elle peut être résistantes à plusieurs antibiotiques, y compris les aminopénicillines. Le nom vient de Hafnia du nom latin de Copenhague. Hafnia alvei est utilisé comme un ferment lactique par l'industrie laitière et, plus récemment, en tant que probiotique inclus dans un complément alimentaire.

Historique[modifier | modifier le code]

Le genre Hafnia est l'un des 40 genres qui constituent actuellement la famille des Entérobactéries.

Bien que décrit par Møller décrit en 1954, la légitimité de ce groupe a été constamment remise en question au cours des deux décennies suivantes, souvent désignées par des synonymes tels que “Enterobacter alvei”, “Enterobacter aerogenes subsp. hafniae” et “Enterobacter hafniae” mais, la bactérie est surtout référencée dans la littérature par son nom actuel, Hafnia alvei.

En 1977, une étude a conclu qu'à la fin de la fabrication du camembert, Hafnia alvei demeure l'espèce dominante. Hafnia alvei est une souche psychrotrophique, qui peut se développer à basse température, ce qui signifie qu'elle ne cesse pas de croître au cours de la phase de stockage de fromage contrairement à E. coli[1].

En 1983, la famille des Entérobactéries a été découverte dans le camembert fraîchement produit : 51% des Entérobactéries ont été répertoriées comme étant des souches Hafnia alvei contre seulement 9% répertoriées comme Escherichia coli. Ces auteurs ont également montré qu'Hafnia alvei peut être trouvée à une concentration élevée dans le fromage (jusqu'à 107 UFC/g), dans le lait cru et les fromages au lait pasteurisé.

Quelques années plus tard, en 1987, Hafnia alvei a été identifiée par une équipe espagnole dans du lait cru de brebis et représentait 6,5% du total des Enterobacteriaceae.

En 2014, une étude collaborative sur l'affinage du fromage, entre un laboratoire de l'INRA et une université italienne, a identifié H. alvei dans le lait cru utilisé pour faire le fromage traditionnel Caciocavallo Pugliese.

Hafnia alvei est également présent dans les aliments fermentés autres que les produits laitiers. Il a été identifié ces dernières années dans de nombreux plats traditionnels autour de la planète.

En 1987, des scientifiques américains étudiant les Brassicaceae y ont trouvé Hafnia alvei. En analysant la microflore du chou frisé fraîchement récolté chou frisé, ils croyaient que l'oringine d'Hafnia alvei était une contamination du sol.

En 2014, Hafnia alvei a été identifié dans l'Aakhone, un plat traditionnel de l'Inde du Nord à base de farine de soja fermenté[2].

Hafnia a également été identifiée dans les graines  de café fermentée d'Éthiopie et dans l'Ohio aux Etats-unis[3]. Des chercheurs américains ont étudié le microbiome des graines de café et identifié Hafnia alvei parmi de nombreuses autres souches et espèces, dont 13 espèces d'Enterobacteriales[4]. Cette étude a mis en évidence que la richesse du microbiome  des graines était lié au processus de fermentation ainsi qu'à la qualité du café. La famille de bactéries la plus fréquemment identifiée était celle des Enterobacteriales contenant Hafnia alvei. Cette famille est souvent trouvée dans les milieux humides et riches en éléments nutritifs similaires à celles du café. Ainsi, cette bactérie pourrait jouer un rôle essentiel dans la fermentation.

Hafnia alvei a également été identifié dans leKimchi, un plat traditionnel coréen composé de chou,asiatique, de radis, d'épices et de fruits de mer fermentés et salés. Les scientifiques pensent que la source d'Hafnia provient des fruits de mer fermentés[5].

En 2004, des scientifiques mexicains ont isolé Hafnia alvei (parmi d'autres bactéries telles que Lactobacillus acidophilus ou plantarum) à partir de Pulque une boisson traditionnelle faite par fermentation du maguey (aussi connu comme l'agave)[6].

Enfin, Hafnia alvei a également été isolée à partir de la viande, et plus particulièrement de la viande de bœuf réfrigérée. La bactérie peut être trouvée au côté d'E. Coli dans le chorizo, une saucisse espagnole[7].emi-sèche et fermentées. Certains saucissons produits en Espagne ont également été signalés comme pouvant contenir la souche Hafnia alvei , responsable de la production de l'histamine qui est cruciale pour le processus de maturation[8].

Références[modifier | modifier le code]

  1. ↑ R. MOURGUES, L. VASSAL, J. AUCLAIR, G. MOCQUOT et J. VANDEWEGHE, « Origine et développement des bactéries coliformes dans les fromages à pâte molle », Le Lait, vol. 57, nos 563-564,‎ , p. 131–149 (ISSN 0023-7302, DOI 10.1051/lait:1977563-5645, lire en ligne)
  2. ↑ Chitta Ranjan Deb et Bendangnaro Jamir, « Nutritional Assessment and Molecular Identification of Microorganisms from Akhuni/Axone: A Soybean Based Fermented Food of Nagaland, India », JOURNAL OF ADVANCES IN BIOLOGY, vol. 11, no 1,‎ , p. 2170–2179 (ISSN 2347-6893, DOI 10.24297/jab.v11i1.7118, lire en ligne)
  3. ↑ « {{{1}}} »
  4. ↑ Michael Joe Vaughan, Thomas Mitchell et Brian B. McSpadden Gardener, « What's Inside That Seed We Brew? A New Approach To Mining the Coffee Microbiome », Applied and Environmental Microbiology, vol. 81, no 19,‎ , p. 6518–6527 (ISSN 0099-2240, DOI 10.1128/aem.01933-15, lire en ligne)
  5. ↑ Myunghee Kim, « Isolation of Hafnia Species from Kimchi », Journal of Microbiology and Biotechnology,‎ (ISSN 1017-7825, DOI 10.4014/jmb.0807.416, lire en ligne)
  6. ↑ A ESCALANTE, « Characterization of bacterial diversity in Pulque, a traditional Mexican alcoholic fermented beverage, as determined by 16S rDNA analysis », FEMS Microbiology Letters, vol. 235, no 2,‎ , p. 273–279 (ISSN 0378-1097, DOI 10.1016/j.femsle.2004.04.045, lire en ligne)
  7. ↑ A Castaño, M.C Garcı́a Fontán, J.M Fresno et M.E Tornadijo, « Survival of Enterobacteriaceae during processing of Chorizo de cebolla, a Spanish fermented sausage », Food Control, vol. 13, no 2,‎ , p. 107–115 (ISSN 0956-7135, DOI 10.1016/s0956-7135(01)00089-5, lire en ligne)
  8. ↑ A.X. Roig-Sagués, M.M. Hernàndez-Herrero, E.I. López-Sabater et J.J. Rodríguez-Jerez, « Evaluation of three decarboxylating agar media to detect histamine and tyramine-producing bacteria in ripened sausages », Letters in Applied Microbiology, vol. 25, no 5,‎ , p. 309–312 (ISSN 0266-8254, DOI 10.1046/j.1472-765x.1997.00223.x, lire en ligne)
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